研究人员对可使家禽患病的耐药肠炎沙门氏菌菌株进行基因组测序
立即发布
北卡罗莱纳州立大学的研究人员对一种致命病毒的基因组进行了测序沙门氏菌肠炎是一种连续几年使两个家禽患病的菌株，发现它既具有抗生素耐药性，也可能感染人类。确定菌株SE_TAU19的特征将有助于公共卫生机构追踪疫情并防止接触。
有两种沙门氏菌，其中一个，沙门氏菌血清与人类疾病有关美国血清含有超过2500种血清或细菌群，其中许多可导致人类疾病。沙门氏菌血清肠炎(SE)最常与家禽有关，是全球人类疾病的主要原因。
大多数人类沙门氏菌感染的源头是食源性的，许多动物——比如鸡——可以携带病原体而自己不生病。格雷森·沃克(Grayson Walker)对SE_TAU19在家禽中引起临床疾病的能力感兴趣，他是北卡罗来纳州兽医学院卢克·博斯特(Luke Borst)实验室的博士生，也是一篇描述该研究的论文的第一作者。
我们通常认为沙门氏菌被鸡收留而不伤害它们;然而，这种菌株是有毒的，实际上使他们生病了，”沃克说。“我们也知道这一点沙门氏菌喜欢逗留。该菌株在整个生长过程中都能杀死肉鸡，并在一年后在不同的鸡群中再次出现。所以，我们决定对基因组进行排序，看看是哪些抗性和毒性特征使该菌株独一无二。”
研究小组对该菌株的基因组进行了测序，发现它包括7个抗菌素耐药性基因、120个毒力基因和一个大型毒力质粒。质粒是“可交换”的基因元素，可以在菌株之间交换，使它们更具耐药性或传染性。
“虽然我们不能说它是一种‘新’菌株沙门氏菌在美国，我们可以说，这种菌株不仅对家禽是致命的，对抗生素具有耐药性和传染性，而且它还可以感染人类，”沃克说。“好消息是，通过对基因组进行排序，我们现在有了数据，可以帮助确定疾病的起源，并控制未来任何疫情的爆发。”
这项研究发表在兽医科学前沿并得到美国农业部动物植物卫生检验处国家生物和农业防御设施科学家培训计划的支持。全基因组测序是由FDA GenomeTrakr项目在Sid Thakur的实验室完成的，Sid Thakur是人口健康和病理生物学教授，也是北卡罗来纳州立大学和兽医学院全球健康项目主任。博斯特，北卡罗来纳州立大学兽医解剖病理学副教授，通讯作者。
皮克-
编辑:一个抽象的。
一株耐萘啶酸肠炎沙门氏菌在肉鸡持续感染中的基因组特征
DOI:10.3389 / fvets.2021.725737
作者: Grayson K. Walker, M. Mitsu suymoto, Dawn M. Hull, Sesny Gall, Fernando Jimenez, Laura R. Chen, Siddhartha Thakur, Rocio Crespo，和Luke B. Borst，北卡罗莱纳州立大学
发表2021年9月1日兽医科学前沿
文摘:
肠沙门氏菌亚种毒性菌株。家禽携带的血清肠杆菌肠炎(SE)可在家禽中引起疾病，并可能导致人类食源性疾病。在同一前提下，相隔一年的两个肉鸡群在整个生长期都因SE引起的败血症而死亡。肉眼病变主要包括多浆膜炎，其次是卵黄囊炎、关节炎、骨髓炎和脊柱炎。对有病变的组织进行培养，得到59株SE菌株。通过Rep-PCR进行基因分型，并对15株克隆菌株进行全基因组测序。该菌株SE_TAU19在肉鸡胚胎致死率试验中进行了进一步的抗菌敏感性和毒力表征。SE_TAU19对nalidioxic acid和磺胺二甲氧嘧啶具有抗性，对所有受毒肉鸡胚胎在3.5 d内均有100%的致死率。血清特异性pserv毒力质粒。pef、spv和rck毒力基因定位于质粒序列组装。 We report phenotypic and genomic features of a virulent SE strain from persistently infected broiler flocks and present a workflow for SE characterization from isolate collection to genome assembly and sequence analysis. Further SE surveillance and investigation of SE virulence in broiler chickens is warranted.
- 类别:
